Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Clip1Q922J3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clip1Q922J3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms