Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tubb6Q922F4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms