Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK0

Lrrc49, Leucine-rich repeat-containing protein 49, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc49Q91YK0 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrc49Q91YK0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc49Q91YK0 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms