Protein–RNA interactions for Protein: Q91YI1

Atg13, Autophagy-related protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg13Q91YI1 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms