Protein–RNA interactions for Protein: Q91YE8

Synpo2, Synaptopodin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Synpo2Q91YE8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Synpo2Q91YE8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Synpo2Q91YE8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Synpo2Q91YE8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Synpo2Q91YE8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Synpo2Q91YE8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Synpo2Q91YE8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Synpo2Q91YE8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Synpo2Q91YE8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Synpo2Q91YE8 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Synpo2Q91YE8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Synpo2Q91YE8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Synpo2Q91YE8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Synpo2Q91YE8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Synpo2Q91YE8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Synpo2Q91YE8 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Synpo2Q91YE8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Synpo2Q91YE8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Synpo2Q91YE8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Synpo2Q91YE8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Synpo2Q91YE8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Synpo2Q91YE8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Synpo2Q91YE8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Synpo2Q91YE8 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Synpo2Q91YE8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Synpo2Q91YE8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Synpo2Q91YE8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Synpo2Q91YE8 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Synpo2Q91YE8 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Synpo2Q91YE8 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Synpo2Q91YE8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Synpo2Q91YE8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Synpo2Q91YE8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Synpo2Q91YE8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Synpo2Q91YE8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Synpo2Q91YE8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Synpo2Q91YE8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Synpo2Q91YE8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Synpo2Q91YE8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Synpo2Q91YE8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Synpo2Q91YE8 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Synpo2Q91YE8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Synpo2Q91YE8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Synpo2Q91YE8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Synpo2Q91YE8 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Synpo2Q91YE8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Synpo2Q91YE8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Synpo2Q91YE8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Synpo2Q91YE8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Synpo2Q91YE8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Synpo2Q91YE8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Synpo2Q91YE8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms