Protein–RNA interactions for Protein: Q91YD4

Trpm2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm2Q91YD4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpm2Q91YD4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpm2Q91YD4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpm2Q91YD4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Trpm2Q91YD4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Trpm2Q91YD4 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Trpm2Q91YD4 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpm2Q91YD4 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms