Protein–RNA interactions for Protein: Q91WL6

Snx11, Sorting nexin-11, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx11Q91WL6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snx11Q91WL6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx11Q91WL6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms