Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43452-201ENSMUST00000201873 991 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8502-201ENSMUST00000185708 901 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8510-201ENSMUST00000189202 895 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm2316-201ENSMUST00000190613 921 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms