Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ9

Vps4a, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4aQ8VEJ9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vps4aQ8VEJ9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms