Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE80

Thoc3, THO complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thoc3Q8VE80 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thoc3Q8VE80 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms