Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stx18Q8VDS8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx18Q8VDS8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms