Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc12Q8R344 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms