Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2N0

Ccdc59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc59Q8R2N0 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc59Q8R2N0 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc59Q8R2N0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc59Q8R2N0 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc59Q8R2N0 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc59Q8R2N0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc59Q8R2N0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc59Q8R2N0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc59Q8R2N0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc59Q8R2N0 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc59Q8R2N0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc59Q8R2N0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc59Q8R2N0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc59Q8R2N0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc59Q8R2N0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc59Q8R2N0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc59Q8R2N0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc59Q8R2N0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc59Q8R2N0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc59Q8R2N0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc59Q8R2N0 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc59Q8R2N0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc59Q8R2N0 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc59Q8R2N0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc59Q8R2N0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc59Q8R2N0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc59Q8R2N0 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc59Q8R2N0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc59Q8R2N0 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc59Q8R2N0 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc59Q8R2N0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc59Q8R2N0 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc59Q8R2N0 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc59Q8R2N0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc59Q8R2N0 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc59Q8R2N0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc59Q8R2N0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc59Q8R2N0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc59Q8R2N0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc59Q8R2N0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc59Q8R2N0 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc59Q8R2N0 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc59Q8R2N0 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc59Q8R2N0 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc59Q8R2N0 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc59Q8R2N0 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc59Q8R2N0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc59Q8R2N0 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc59Q8R2N0 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc59Q8R2N0 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc59Q8R2N0 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc59Q8R2N0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc59Q8R2N0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc59Q8R2N0 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc59Q8R2N0 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc59Q8R2N0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc59Q8R2N0 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc59Q8R2N0 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc59Q8R2N0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc59Q8R2N0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc59Q8R2N0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc59Q8R2N0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc59Q8R2N0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc59Q8R2N0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc59Q8R2N0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc59Q8R2N0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc59Q8R2N0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc59Q8R2N0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc59Q8R2N0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc59Q8R2N0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc59Q8R2N0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc59Q8R2N0 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc59Q8R2N0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc59Q8R2N0 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc59Q8R2N0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc59Q8R2N0 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc59Q8R2N0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc59Q8R2N0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc59Q8R2N0 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc59Q8R2N0 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc59Q8R2N0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc59Q8R2N0 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc59Q8R2N0 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc59Q8R2N0 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc59Q8R2N0 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc59Q8R2N0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc59Q8R2N0 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc59Q8R2N0 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc59Q8R2N0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc59Q8R2N0 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc59Q8R2N0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc59Q8R2N0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc59Q8R2N0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc59Q8R2N0 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc59Q8R2N0 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc59Q8R2N0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc59Q8R2N0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc59Q8R2N0 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc59Q8R2N0 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc59Q8R2N0 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms