Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1M2

H2afj, Histone H2A.J, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afjQ8R1M2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2afjQ8R1M2 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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