Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms