Protein–RNA interactions for Protein: Q8K558

Treml1, Trem-like transcript 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml1Q8K558 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Treml1Q8K558 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms