Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
MyripQ8K3I4 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms