Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdk5rap2Q8K389 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cdk5rap2Q8K389 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cdk5rap2Q8K389 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cdk5rap2Q8K389 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cdk5rap2Q8K389 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdk5rap2Q8K389 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdk5rap2Q8K389 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdk5rap2Q8K389 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdk5rap2Q8K389 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdk5rap2Q8K389 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cdk5rap2Q8K389 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdk5rap2Q8K389 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdk5rap2Q8K389 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdk5rap2Q8K389 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdk5rap2Q8K389 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms