Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y9

Ccm2, Cerebral cavernous malformations protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2Q8K2Y9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccm2Q8K2Y9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccm2Q8K2Y9 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms