Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y7

Mrpl47, 39S ribosomal protein L47, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl47Q8K2Y7 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl47Q8K2Y7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms