Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c1Q8K284 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c1Q8K284 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms