Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sde2Q8K1J5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sde2Q8K1J5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms