Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E0

Stx5, Syntaxin-5, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx5Q8K1E0 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx5Q8K1E0 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms