Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FgbQ8K0E8 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FgbQ8K0E8 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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