Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Pkn3Q8K045 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Pkn3Q8K045 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkn3Q8K045 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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