Protein–RNA interactions for Protein: Q8K021

Scamp1, Secretory carrier-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp1Q8K021 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scamp1Q8K021 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scamp1Q8K021 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms