Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Trip10Q8CJ53 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip10Q8CJ53 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms