Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CopaQ8CIE6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms