Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIA5

Slc35b4, UDP-xylose and UDP-N-acetylglucosamine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc35b4Q8CIA5 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc35b4Q8CIA5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc35b4Q8CIA5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc35b4Q8CIA5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc35b4Q8CIA5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc35b4Q8CIA5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc35b4Q8CIA5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc35b4Q8CIA5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc35b4Q8CIA5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc35b4Q8CIA5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc35b4Q8CIA5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc35b4Q8CIA5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc35b4Q8CIA5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc35b4Q8CIA5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms