Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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