Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc87Q8CDL9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc87Q8CDL9 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms