Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC88

Vwa8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa8Q8CC88 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Vwa8Q8CC88 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Vwa8Q8CC88 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Vwa8Q8CC88 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Vwa8Q8CC88 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Vwa8Q8CC88 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Vwa8Q8CC88 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vwa8Q8CC88 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms