Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cacnb2Q8CC27 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cacnb2Q8CC27 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacnb2Q8CC27 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97 ms