Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB27

Yod1, Ubiquitin thioesterase OTU1, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yod1Q8CB27 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Yod1Q8CB27 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Yod1Q8CB27 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Yod1Q8CB27 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Yod1Q8CB27 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Yod1Q8CB27 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Yod1Q8CB27 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Yod1Q8CB27 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms