Protein–RNA interactions for Protein: Q8C963

Ccdc159, Coiled-coil domain-containing protein 159, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc159Q8C963 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc159Q8C963 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms