Protein–RNA interactions for Protein: Q8C159

Ttc22, Tetratricopeptide repeat protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc22Q8C159 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Ttc22Q8C159 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc22Q8C159 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc22Q8C159 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc22Q8C159 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc22Q8C159 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ttc22Q8C159 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ttc22Q8C159 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
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Ttc22Q8C159 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Ttc22Q8C159 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Ttc22Q8C159 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Ttc22Q8C159 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc22Q8C159 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc22Q8C159 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc22Q8C159 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc22Q8C159 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc22Q8C159 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc22Q8C159 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc22Q8C159 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc22Q8C159 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc22Q8C159 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc22Q8C159 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc22Q8C159 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc22Q8C159 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc22Q8C159 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc22Q8C159 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc22Q8C159 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc22Q8C159 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc22Q8C159 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms