Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Y1

Tgif2, Homeobox protein TGIF2, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif2Q8C0Y1 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgif2Q8C0Y1 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgif2Q8C0Y1 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgif2Q8C0Y1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgif2Q8C0Y1 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgif2Q8C0Y1 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgif2Q8C0Y1 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgif2Q8C0Y1 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgif2Q8C0Y1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgif2Q8C0Y1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgif2Q8C0Y1 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgif2Q8C0Y1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgif2Q8C0Y1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgif2Q8C0Y1 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgif2Q8C0Y1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgif2Q8C0Y1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgif2Q8C0Y1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tgif2Q8C0Y1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgif2Q8C0Y1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgif2Q8C0Y1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgif2Q8C0Y1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgif2Q8C0Y1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgif2Q8C0Y1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgif2Q8C0Y1 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgif2Q8C0Y1 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgif2Q8C0Y1 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgif2Q8C0Y1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgif2Q8C0Y1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgif2Q8C0Y1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgif2Q8C0Y1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgif2Q8C0Y1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgif2Q8C0Y1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgif2Q8C0Y1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgif2Q8C0Y1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgif2Q8C0Y1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgif2Q8C0Y1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgif2Q8C0Y1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgif2Q8C0Y1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgif2Q8C0Y1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tgif2Q8C0Y1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgif2Q8C0Y1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgif2Q8C0Y1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgif2Q8C0Y1 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgif2Q8C0Y1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgif2Q8C0Y1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgif2Q8C0Y1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgif2Q8C0Y1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgif2Q8C0Y1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgif2Q8C0Y1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgif2Q8C0Y1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgif2Q8C0Y1 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgif2Q8C0Y1 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgif2Q8C0Y1 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgif2Q8C0Y1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgif2Q8C0Y1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgif2Q8C0Y1 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgif2Q8C0Y1 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgif2Q8C0Y1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgif2Q8C0Y1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgif2Q8C0Y1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgif2Q8C0Y1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgif2Q8C0Y1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tgif2Q8C0Y1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tgif2Q8C0Y1 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tgif2Q8C0Y1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tgif2Q8C0Y1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tgif2Q8C0Y1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tgif2Q8C0Y1 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms