Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atg16l1Q8C0J2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms