Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Snx16Q8C080 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Snx16Q8C080 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Snx16Q8C080 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Snx16Q8C080 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Snx16Q8C080 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Snx16Q8C080 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Snx16Q8C080 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx16Q8C080 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx16Q8C080 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx16Q8C080 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx16Q8C080 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx16Q8C080 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx16Q8C080 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx16Q8C080 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx16Q8C080 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx16Q8C080 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx16Q8C080 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx16Q8C080 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx16Q8C080 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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