Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Gm15937-201ENSMUST00000120727 1235 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Vmn1r18-201ENSMUST00000164732 1087 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Gm5726-201ENSMUST00000173886 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Gm8677-201ENSMUST00000174637 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 1700051K13Rik-201ENSMUST00000204426 696 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 AC165260.4-201ENSMUST00000225924 724 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Olfr1164-201ENSMUST00000099834 1112 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 4931412I15Rik-201ENSMUST00000207844 1448 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Gm8206-203ENSMUST00000171428 997 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Mir669a-7-201ENSMUST00000180364 87 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Gm37678-201ENSMUST00000192908 1146 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Mir669a-6-201ENSMUST00000196127 87 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Mir669a-12-201ENSMUST00000197274 87 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Mir669a-5-201ENSMUST00000197439 87 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Mir669a-10-201ENSMUST00000197745 87 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Mir669a-11-201ENSMUST00000197952 87 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Mir669a-4-201ENSMUST00000198665 87 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Mir669a-9-201ENSMUST00000200087 87 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Mir669a-8-201ENSMUST00000200268 87 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Gm45604-201ENSMUST00000209665 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Olfr854-202ENSMUST00000212872 939 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 D030068K23Rik-203ENSMUST00000181098 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Gm8089-201ENSMUST00000122463 968 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Ppp1r2-ps9-202ENSMUST00000173852 882 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Gm43794-201ENSMUST00000200971 692 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Gm10419-201ENSMUST00000100944 1671 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim35Q8C006 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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