Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
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Usp38Q8BW70 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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Usp38Q8BW70 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp38Q8BW70 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp38Q8BW70 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
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