Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV16

Zfp398, Zinc finger protein 398, mousemouse

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Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp398Q8BV16 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Zfp398Q8BV16 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp398Q8BV16 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp398Q8BV16 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp398Q8BV16 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp398Q8BV16 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp398Q8BV16 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Zfp398Q8BV16 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp398Q8BV16 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp398Q8BV16 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp398Q8BV16 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp398Q8BV16 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp398Q8BV16 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Zfp398Q8BV16 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp398Q8BV16 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp398Q8BV16 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp398Q8BV16 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp398Q8BV16 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Zfp398Q8BV16 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Zfp398Q8BV16 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Zfp398Q8BV16 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp398Q8BV16 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp398Q8BV16 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp398Q8BV16 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp398Q8BV16 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp398Q8BV16 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp398Q8BV16 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Zfp398Q8BV16 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Zfp398Q8BV16 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Zfp398Q8BV16 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Zfp398Q8BV16 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Zfp398Q8BV16 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp398Q8BV16 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp398Q8BV16 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp398Q8BV16 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp398Q8BV16 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp398Q8BV16 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp398Q8BV16 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp398Q8BV16 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp398Q8BV16 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp398Q8BV16 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp398Q8BV16 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp398Q8BV16 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp398Q8BV16 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp398Q8BV16 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp398Q8BV16 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp398Q8BV16 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp398Q8BV16 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp398Q8BV16 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp398Q8BV16 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp398Q8BV16 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp398Q8BV16 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms