Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSU2

Cxcl16, C-X-C motif chemokine 16, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl16Q8BSU2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Cxcl16Q8BSU2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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Cxcl16Q8BSU2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Cxcl16Q8BSU2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Cxcl16Q8BSU2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Cxcl16Q8BSU2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Cxcl16Q8BSU2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Cxcl16Q8BSU2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Cxcl16Q8BSU2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Cxcl16Q8BSU2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl16Q8BSU2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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