Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQR7

Mageb18, Melanoma-associated antigen B18, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mageb18Q8BQR7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mageb18Q8BQR7 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mageb18Q8BQR7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mageb18Q8BQR7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mageb18Q8BQR7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mageb18Q8BQR7 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mageb18Q8BQR7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Mageb18Q8BQR7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mageb18Q8BQR7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mageb18Q8BQR7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mageb18Q8BQR7 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mageb18Q8BQR7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mageb18Q8BQR7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mageb18Q8BQR7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mageb18Q8BQR7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Mageb18Q8BQR7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Mageb18Q8BQR7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mageb18Q8BQR7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mageb18Q8BQR7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mageb18Q8BQR7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Mageb18Q8BQR7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mageb18Q8BQR7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mageb18Q8BQR7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mageb18Q8BQR7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mageb18Q8BQR7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mageb18Q8BQR7 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mageb18Q8BQR7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mageb18Q8BQR7 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mageb18Q8BQR7 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mageb18Q8BQR7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mageb18Q8BQR7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Mageb18Q8BQR7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mageb18Q8BQR7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mageb18Q8BQR7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mageb18Q8BQR7 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mageb18Q8BQR7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mageb18Q8BQR7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Mageb18Q8BQR7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mageb18Q8BQR7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mageb18Q8BQR7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Mageb18Q8BQR7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mageb18Q8BQR7 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
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Mageb18Q8BQR7 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mageb18Q8BQR7 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Mageb18Q8BQR7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Mageb18Q8BQR7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Mageb18Q8BQR7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Mageb18Q8BQR7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mageb18Q8BQR7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mageb18Q8BQR7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mageb18Q8BQR7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mageb18Q8BQR7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mageb18Q8BQR7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mageb18Q8BQR7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mageb18Q8BQR7 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mageb18Q8BQR7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mageb18Q8BQR7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mageb18Q8BQR7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mageb18Q8BQR7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mageb18Q8BQR7 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mageb18Q8BQR7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mageb18Q8BQR7 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mageb18Q8BQR7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mageb18Q8BQR7 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mageb18Q8BQR7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mageb18Q8BQR7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mageb18Q8BQR7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mageb18Q8BQR7 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mageb18Q8BQR7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Mageb18Q8BQR7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mageb18Q8BQR7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mageb18Q8BQR7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms