Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Usp54Q8BL06 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp54Q8BL06 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms