Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJZ4

Mrps35, 28S ribosomal protein S35, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrps35Q8BJZ4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrps35Q8BJZ4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms