Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg4dQ8BGV9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atg4dQ8BGV9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atg4dQ8BGV9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atg4dQ8BGV9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atg4dQ8BGV9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atg4dQ8BGV9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atg4dQ8BGV9 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atg4dQ8BGV9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atg4dQ8BGV9 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Atg4dQ8BGV9 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Atg4dQ8BGV9 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Atg4dQ8BGV9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Atg4dQ8BGV9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Atg4dQ8BGV9 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg4dQ8BGV9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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