Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG15

Ctdspl2, CTD small phosphatase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdspl2Q8BG15 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctdspl2Q8BG15 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms