Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
H2-M10.4Q85ZW8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms