Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NfascQ810U3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfascQ810U3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms